Placé sous l’autorité directe du Président, le Secrétariat permanent constitue la colonne vertébrale administrative et technique de l’Office. Il est dirigé par le Secrétaire permanent, choisi parmi les fonctionnaires de la hiérarchie A1 ou assimilée et nommé par décret, ce qui garantit à l’institution une expertise administrative de haut niveau.
Le Secrétaire permanent assiste le Président dans la conception et la mise en œuvre des mesures visant au bon fonctionnement de l’OFNAC. Il assure la coordination administrative des départements, comités, commissions et groupes de travail à travers lesquels s’exerce, au quotidien, le travail d’enquête, d’analyse et de prévention de l’Office.